Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf13bQ9WU72 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms