Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rnf4Q9QZS2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf4Q9QZS2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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