Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripk3Q9QZL0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms