Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms