Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trpc3Q9QZC1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trpc3Q9QZC1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trpc3Q9QZC1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trpc3Q9QZC1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trpc3Q9QZC1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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