Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn8Q9QZ49 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms