Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms