Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tomm40Q9QYA2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tomm40Q9QYA2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms