Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
VapbQ9QY76 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VapbQ9QY76 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms