Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nphp1Q9QY53 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms