Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr2e3Q9QXZ7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms