Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Copg2Q9QXK3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms