Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms