Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Csnk1eQ9JMK2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms