Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vstm2bQ9JME9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm2bQ9JME9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms