Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SrfQ9JM73 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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