Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rabgef1Q9JM13 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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