Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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