Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms