Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TefQ9JLC6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms