Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl39Q9JKF7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.1 ms