Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ybx3Q9JKB3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ybx3Q9JKB3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms