Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Pgpep1Q9ESW8 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pgpep1Q9ESW8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms