Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim39Q9ESN2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms