Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms