Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snap29Q9ERB0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms