Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms