Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xab2Q9DCD2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms