Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf6Q9DBU5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms