Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms