Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rsph3bQ9DA80 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms