Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Usp12Q9D9M2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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