Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atg7Q9D906 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atg7Q9D906 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms