Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot8Q9D8X5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms