Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl4Q9D8E6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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