Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Med11Q9D8C6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Med11Q9D8C6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms