Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chmp4bQ9D8B3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms