Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cyp2c55Q9D816 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cyp2c55Q9D816 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cyp2c55Q9D816 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cyp2c55Q9D816 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cyp2c55Q9D816 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cyp2c55Q9D816 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cyp2c55Q9D816 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cyp2c55Q9D816 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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