Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nop56Q9D6Z1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nop56Q9D6Z1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Nop56Q9D6Z1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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