Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rab11fip1Q9D620 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11fip1Q9D620 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Rab11fip1Q9D620 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab11fip1Q9D620 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab11fip1Q9D620 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Rab11fip1Q9D620 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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