Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ccdc7Q9D541 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ccdc7Q9D541 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ccdc7Q9D541 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc7Q9D541 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms