Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Zc2hc1bQ9D534 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms