Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc105Q9D4K7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc105Q9D4K7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms