Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pabpc6Q9D4E6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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