Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snrnp35Q9D384 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrnp35Q9D384 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms