Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed3Q9D0L1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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