Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Rfc5Q9D0F6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rfc5Q9D0F6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rfc5Q9D0F6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rfc5Q9D0F6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Rfc5Q9D0F6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rfc5Q9D0F6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Rfc5Q9D0F6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Rfc5Q9D0F6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rfc5Q9D0F6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Rfc5Q9D0F6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Rfc5Q9D0F6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rfc5Q9D0F6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Rfc5Q9D0F6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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