Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ndc80Q9D0F1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ndc80Q9D0F1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ndc80Q9D0F1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ndc80Q9D0F1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ndc80Q9D0F1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ndc80Q9D0F1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ndc80Q9D0F1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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