Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Acsl3Q9CZW4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Acsl3Q9CZW4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms