Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc77Q9CZH8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms